בערב יום הכיפורים ובצאתו תופעלנה הרכבות על פי לוח זמנים ייעודי, הכולל שינויים מסוימים בלוחות הזמנים.
בערב יום הכיפורים, יום (שלישי 8/10/19) תופעלנה רכבות הנוסעים במהלך שעות הבוקר והצהריים על פי לוחות זמנים של ימי שישי. ביום זה יופעל שירות רכבות הלילה (הלילה שבין שני לשלישי) לנתב"ג במתכונת רגילה (רכבת אחת לשעה לכל כיוון). במהלך שעות היום ועד סיום השירות בהדרגה בשעה 13:00 (בקירוב) יופעל שירות רכבות בין תחנות ת"א סבידור מרכז לנתב"ג ומודיעין ובין תחנות ת"א סבידור מרכז ללוד במתכונת רכבת אחת לשעה לכל כיוון.
במוצאי יום כיפור יום (רביעי 9/10/19) כמידי שנה, לא תופעלנה רכבות, מלבד שתי רכבות:
רכבת מספר 8001 היוצאת מתחנת נהריה לתחנת נתב"ג בשעה 23:13. הרכבת תעצור בתחנות עכו; קריית מוצקין; תחנות חיפה; בנימינה; חדרה מערב; נתניה; הרצליה; תל אביב סבידור מרכז; תל אביב ההגנה, ותסיים את נסיעתה בתחנת נתב"ג.
רכבת מספר 8590 היוצאת מתחנת ב"ש מרכז לתחנת ת"א ההגנה בשעה 23:51.
הרכבת תעצור בתחנות: אופקים, נתיבות, שדרות, אשקלון, אשדוד עד-הלום, יבנה מערב, ראשל"צ משה דיין, בת ים – יוספטל ותסיים את נסיעתה בתחנת ת"א ההגנה.
תנועת הרכבות תחודש במלואה לאחר חצות הלילה שבין יום רביעי לחמישי, בתאריך 10.10.19.
ברכבת ישראל ממליצים לנוסעים בימים אלה להתעדכן בשינויים בלוחות הזמנים באמצעות אתר האינטרנט והיישומון, ומאחלים שנה טובה וגמר חתימה טובה.