עמוס שפירא נכנס לתפקידו כנשיא אוניברסיטת חיפה
"אני גאה לחזור לאוניברסיטת חיפה.
ככל אוניברסיטת מחקר מובילה, אוניברסיטת חיפה ראתה תמיד בקיום המחקר וההוראה האקדמיים המצטיינים את יעודה העיקרי".
"מעבר למצוינות במחקר והוראה לאוניברסיטת חיפה תרומה אסטרטגית ייחודית למדינה ולחברה ביצירת חוויה אזרחית משותפת לקבוצות האוכלוסייה השונות ובחיזוקו ושמורו של אזור הצפון כנכס אסטרטגי של ישראל."
בדבריו ציין שפירא את היותה של האוניברסיטה ייחודית ומצטיינת בתחומים רבים כגון חקר הימים, חינוך, פסיכולוגיה, לקויות למידה, חקר השואה, חקר המח והאבולוציה ותחומים רבים נוספים. אולם לצד מצוינות אקדמית לאוניברסיטת חיפה יש שני תפקידים אסטרטגיים נוספים ההכרחיים להמשך קיומה ושגשוגה של מדינת ישראל.
הראשון הוא היותה אוניברסיטת המחקר היחידה באזור הצפון אשר קיומה הכרחי להמשך קיומו של אזור הצפון ולמניעת הפיכתה של ישראל למדינת גוש דן, על כל הסכנות האסטרטגיות הנובעות מכך.
התפקיד השני נובע מההרכב הייחודי של אוכלוסיית הסטודנטים ואנשי הסגל ותרומתה הייחודית של אוניברסיטת חיפה ליצירת חוויה אזרחית משותפת ההכרחית להמשך קיומה ושגשוגה של ישראל.
שפירא התייחס לאווירה הייחודית שיש באוניברסיטה: "המחקר האקדמי וההוראה הוא לב ליבה של כל אוניברסיטת מחקר, אולם לצד אלה פיעמה באוניברסיטת חיפה תמיד רוח רעננה וייחודית, עם פסיפס אנושי שכלל את כל קבוצות האוכלוסייה: יהודים וערבים, ותיקים ועולים חדשים, חילונים ודתיים בני כל העדות והדתות. לצד המצוינות האקדמית והמחקרית, אוניברסיטת חיפה ידעה תמיד ותדע תמיד לתרום לקיום המשותף של קבוצות האוכלוסייה השונות בישראל.
תרומה זו הינה צורך אסטרטגי של מדינת ישראל".
הוא גם הוסיף כי הנכס העיקרי של האוניברסיטה הינו הסגל המנהלי והאקדמי שלה השוקד על טיפוח מצוינות המחקר, ההוראה והשרות באוניברסיטה.
עם כניסתו לתפקיד סוגר שפירא מעגל אקדמי: את התואר הראשון שלו בכלכלה הוא סיים בראשית שנות ה-80 באוניברסיטת חיפה, כשעבודתו הראשונה הייתה כעוזר הוראה בחוג לכלכלה. "אני גאה לשוב לאוניברסיטה שבה עשיתי את צעדי הראשונים ושהעניקה לי את התשתית הכל כך חשובה להצלחה – הן מבחינה מקצועית והן מבחינה אנושית", אמר שפירא.
שפירא הודה לנשיא היוצא של האוניברסיטה בשמונה השנים האחרונות פרופ' אהרון בן-זאב, אשר פעל רבות לקידומה של האוניברסיטה בתחומים ייחודיים, ובראשם חקר הים התיכון – תחום בעל חשיבות לאומית לכלכלתה ועצמאותה של מדינת ישראל. כמו כן, הודה שפירא לחבר הנאמנים וליו"ר ליאון צ'רני ולוועד המנהל בראשות עמי אילון על האמון שניתן בו.
שפירא שימש עד לאחרונה כמנכ"ל חברת הסלולר המובילה סלקום, ולפני כן כמנכ"ל חברת התעופה הלאומית אל-על.
משנת 2008 ועד לפני מספר חודשים כיהן שפירא כנשיא אגודת הידידים של אוניברסיטת תל-אביב, בה הוביל את "אמנת המעסיקים למען החינוך האקדמי" – אמנה עליה חתמו 300 חברות מהמובילות במשק שקראה להעסקה של בוגרי מדעי הרוח ומדעים מדויקים במגזר העסקי. שפירא גם עסק רבות בשנים האחרונות בהגברת המודעות בקרב קובעי דעת הקהל לתופעת "בריחת המוחות" מהאקדמיה הישראלית והיה חבר בוועד המנהל של ארגון "קו משווה" למתן הזדמנויות תעסוקה שוות לאוכלוסיות המיעוטים בישראל.